Analisis Variasi Genetik Anggrek Rhynchostylis retusa (L.) Blume dengan Marka Molekuler RAPD

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah mendapatkan DNA anggrek Rhynchostylis retusa dengan metode Castillo yang telah dimodifikasi. Sumber DNA genom pada penelitian ini adalah delapan sampel daun muda anggrek R. retusa yang berasal dari beberapa daerah. Satu sampel berasal dari Temanggung, dua sampel berasal dari Tulungagung, dua sampel berasal dari Semeru, dan tiga sampel berasal dari Yogyakarta. Sampel daun dipilih secara acak tanpa memperhatikan aspek posisi atau letak daun pada tanaman anggrek. Penelitian ini merupakan penelitian eksploratif yang dilakukan di Laboratorium Biologi Dasar FMIPA UNY. Isolasi DNA dilakukan dengan metode Castillo dilanjutkan dengan purifikasi DNA hasil isolasi. Pengecekan kualitas DNA hasil isolasi dan purifikasi dilakukan dengan metode elektroforesis dengan agarose 1,5% menggunakan tegangan 100 Volt selama 30 menit. Hasil penelitian menunjukkan bahwa delapan sampel DNA R. retusa yang berhasil diisolasi mempunyai kualitas yang cukup baik.

Kata Kunci: R. retusa, Isolasi DNA, Purifikasi DNA