STRUKTUR DAN DINAMIKA HIDRASI ION Ag+ MENGGUNAKAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL MEKANIKA MOLEKUL

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui: 1) struktur dan 2) dinamika hidrasi ion Ag+
menggunakan simulasi dinamika molekuler mekanika molekul. Subjek penelitian ini adalah simulasi
dinamika molekuler mekanika molekule. Objek penelitian ini adalah struktur dan dinamika ion Ag+.
Prosedur yang dilakukan dalam penelitian ini dengan menentukan koordinat Ag+-H2O dalam koordinat
kartesian, kemudian memilih himpunan basis yang cocok (sesuai dengan grafik Lennard-Jones).
Selanjutnya menentukan potensial pasangan 2bd dan 3bd. Dan yang terakhir adalah menghitung
dengan menggunakan simulasi dinamika molekuler mekanika molekuler yang akan menghasilkan
trajectory yang kemudian diolah lagi dan menghasilkan berupa grafik RDF, CND, ADF dan
pertukaran ligan air dengan Ag+.Hasil penelitian menunjukkan bahwa struktur dari sistem hidrasi ion
Ag+ dengan simulasi dinamika molekuler mekanika molekul 2bd mengikat air sebagai ligan adalah 8
yang sesuai dengan hasil rasmol dengan jarak 3 Å yang menunjukkan hasil bahwa ligan air untuk DM
MM2bd adalah 8. Sedangkan hasil dinamika dari sistem hidrasi ion Ag+ dengan molekul air
menunjukkan hasil dari simulasi DM MM2bd terjadi perpindahan ligan yang menunjukkan bahwa
ligan air dalam hidrasinya bersifat dinamis.
Kata kunci : Simulasi dinamika molekuler, potensial 2-badan, potensial 3-badan, air.